Izvedba predmeta
(5 kreditnih točk)

Predavanja: 30 ur, seminarske vaje: 15 ur
8. semester univerzitetnega študija biokemije.

Predavatelja

prof. dr. Igor Križaj (nosilec predmeta) in doc. dr. Marko Dolinar

Urnik
2009/10

Predavanja: vsak četrtek od 10:15 do 11:45  v seminarski sobi Odseka za biokemijo in mol. biologijo IJS (B220).
Seminarske vaje: vsak ponedeljek od 11:00 do 11:45  prav tam.

Govorilne ure

Igor Križaj: kadarkoli po predhodnem dogovoru po telefonu (01/477-3626) ali e-pošti. Njegova soba je na IJS: stavba B, soba 403.
Marko Dolinar: vsako sredo od 16.15h do 17h in/ali po predhodnem dogovoru po telefonu (01) 241-9480 ali e-pošti. Njegova soba je na IJS: stavba B, soba 109 (tik pred knjižnico).

Cilji

Seznaniti študente s sestavo bioloških membran, njihovo vlogo v celicah in procesih, ki potekajo v/na membranah oziroma prenosu snovi in signalov skozi membrane. Spoznati metode za analizo membranskih komponent, predvsem lipidov in membranskih proteinov.

Seminarji

Teme seminarjev

Vsako razpisano seminarsko temo obdela en študent. Pripraviti je treba seminarsko nalogo v obsegu 10-12 strani (A4, pisava 12, robovi 3 cm) in temo predstaviti tudi ustno (20 min.). Smiselno je, da seminarje ali izvlečke razmnožite še za svoje kolege, saj bodo morali snov znati na izpitu.

Vaje se izvajajo kot seminarske vaje in bodo predvidoma zajemale pregled znanstvene periodike s področja membran in predstavitve posameznih tehnik ali metodoloških pristopov. Aprilski in majski termini so rezervirani za predstavitve seminarskih nalog.

Ocenjevanje

Izpitna snov zajema vse teme predavanj in seminarjev.
Ocena priprave in predstavitve seminarja šteje kot ocena iz vaj.
Izpitna vprašanja pripravljava oba predavatelja ločeno in jih tudi ločeno popravljava, točke pa se seštejejo. Vprašanja so delno za obkrožanje (1 ali več) pravilnih odgovorov, delno pa vpisovanje odgovorov - običajno zadošča nekaj stavkov.

Študijska literatura

Enega samega učbenika za to področje ni, zato si bo treba pomagati s poglavji iz različnih bolj splošnih učbenikov in s članki iz literature.
Podatki o literaturi so navedeni ob temah v razporedu predavanj. Literaturo za seminarje izberejo študenti samostojno.
1) J.M.Berg, J.L.Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry (W.H.Freeman), 5. izdaja, 2002; 1050 str.
2) D. Voet, J. G. Voet: Biochemistry (Wiley), 3. izdaja, 2004; 1591 str.
3) H. Lodish et al.: Molecular cell biology, 4. izdaja, W.H. Freeman and Company, New York, 2000.

Ostalo

Koristne povezave

datum

tema

predavatelj

študijski viri

18.2.

Struktura in dinamika bioloških membran

Dolinar

Stryer: 12. poglavje 
Voet: 12. poglavje

25.2.

Čiščenje celic in njihovih delov

Dolinar

Lodish, pp. 152-157

4.3.

Transport skozi biološke membrane: difuzija, transporterji

Dolinar

Lodish, pp. 578-588

11.3.

Aktivni transport skozi biološke membrane 

Križaj

18.3.

več strokovnih člankov

25.3.

1.4.

Medcelična signalizacija – 1. del
(hormoni in receptorji)

8.4.

Medcelična signalizacija – 2. del
(prenos živčnega signala, ukrivljanje in zlivanje membran)

Križaj

15.4.

Encimi, ki delujejo na membranah in na membrane (medfazna encimatika). Fosfolipaze A₂, struktura in mehanizem delovanja.

22.4.

Povezovanje celic v tkiva

Dolinar

Lodish, pp. 968-1002

6.5.

Lipidi in signalizacija

Dolinar

13.5.

Toksini, ki delujejo na membranah in na membrane - porini: struktura in mehanizem delovanja

Križaj

20.5.

seminarji

Dolinar

27.5.

seminarji

Križaj

št.

tema seminarja

seminar pripravi

datum predstavitve

1

Metabotropni ali z G-proteini sklopljeni receptorji:
mAChR, ß-adrenergični R, nevropeptidni R, mGluR, …

2

Encimsko-sklopljeni receptorji:
Tyr-kinazni receptorji (R za rastne hormone – EGF, PDGF; insulinski), NOR, atrijski  natriuretični faktor R-ANFR, …

3

Modifikacije proteinov z lipidi - način in fiziološka vloga

6

Transport proteinov v in iz jedra

7

Ionotropni ali z ligandi uravnavani ionski kanali:
IP₃R, RyR, nAChR, GlyR, GABA_AR, iGluR (NMDA, AMPA in kainatni R)