POVEZAVE:

organizacije:

• Odseki za biokemijo in molekularno biologijo IJS
• Katedra za biokemijo na Oddelku za biologijo Biotehniške fakultete UL

izobraževanje:

• BioNet Teaching
• Access Excellence  (The National Health Museum): za učitelje naravoslovnih predmetov
• Metabolične poti in Celični in molekularni procesi s skupnim iskalnikom
• Navodila za pripravo dobrega predavanja (Cardiff School of Biosciences)

• Medline na NCBI: iskalni obrazec
• Digitalna knjižnica UL: vstopna stran in katalog e-revij
• E-revije preko UL (samo preko računalnikov Univerze - notranja povezava)
• Knjižnica IJS
• Faktorji vpliva preko Cobissa (1994-2007) - druga povezava v spodnjem delu tabele
  
• ScienceDirect - knjižnica strokovnih revij založbe Elsevier
• Web-of-Science
• COBISS, Slovenska knjižnična mreža; servis osebnih bibliografij raziskovalcev (COBIB), SICRIS - znanost v Sloveniji
• SJR - SCImago Journal & Country Rank: indikatorji kakovosti po državah in revijah
  

• Slovarji v CTK (samo za računalnike znotraj Univerze): angleščina, slovenski knjižni jezik, pravopis,...
• Dictionary of cell biology, 3. izdaja / spletna verzija
• Dictionary of genetic terms na TU München
• Yahoo Thesaurus
• Oxford English Dictionary (samo z računalnikov Univerze),
• Oxford Reference Online: Premium Collection (z računalnikov Univerze),
• English Acronyms and Abbreviations,
• Merriam-Webster's WWWebster Dictionary,
• Angleški slovar, leksikon in tezaver: TheFreeDictionary.com,
• Hypertext Webster
• .Encyclopaedia Britannica  (Academic Edition)

terminologija in enciklopedije v slovenščini:

• Slovenska biokemijska terminologija (Slov. biokem. društvo)
• Kratka enciklopedija splošne biologije, genetike in živinoreje (Biotehn. fakulteta UL)
• Slovenski mikrobiološki slovar (Slovensko Mikrobiološko društvo)
• Seznam rastlinskih in živalskih vrst s šifrantom organizmov: Cirsium (Biotehn. fakulteta UL)
• Medicinski izrazi (Med.over.net)
  

spletni iskalniki:

Metacrawler,

Google,

HotBot.

ORODJA:

Iskalnik zaporedij in struktur pri EMBL,
Iskalnik zaporedij, literature, genomskih podatkov idr. ENTREZ (NCBI),
Iskalnik aminokislinskih zaporedij in drugih lastnosti proteinov SwissProt,
Iskalnik aminokislinskih zaporedij proteinov PIR,
Iskalnik 3D struktur proteinov v zbirki PDB,
Iskalnik zaporedij in njihovih poravnav BCM,
Iskalnik podatkov o encimih E.C.,
Iskalnik slik bioloških makromolekul IMB Jena;

ZANIMIVOSTI:

• 4. in 5. novembra 2007 je na MIT v Cambridgu (ZDA) potekalo srečanje študentskih raziskovalnih skupin s področja sintezne biologije. Na tekmovanju je sodelovalo 37 ekip, med njimi 8 iz Evrope. V konkurenci nekaterih najprestižnejših univerz s celega sveta je ekipa ljubljanske univerze dosegle izreden uspeh, saj je dosegla skupno prvo mesto. Ekipo je sestavljalo 9 študentov (večina je bila mikrobiologov, ena je bila fizičarka in en biokemik), vodji ekipe pa sta bila prof. Roman Jerala s Kemijskega inštituta (na naši fakulteti predava Bioinformatiko) in doc. Marko Dolinar s Katedre za biokemijo FKKT. Raziskovalno delo je bilo s področja prenosa signala s površine okužene celice v jedro. Z uvedbo zapisa za mutirano obliko proteina MyD88 v celice so se te po večkratni stimulaciji z bakterijskimi proteini odzvale na tak način, da se je sinteza mediatorjev vnetja zmanjšala, ne pa povečala. Takšne celice ne bi mogle povzročiti sepse, za katero v Evropi vsako leto zboli okrog 750.000 ljudi, od teh jih petina umre. (iGEM) (9.11.)
• Med dvanajstimi letošnjimi dobitniki študentskih Prešernovih nagrad Univerze v Ljubljani je bil tudi Miha Kosmač, diplomant študija biokemije (predstavitev njegovega dela je na 2. strani ločenega dokumenta), zdaj pa mladi raziskovalec na Zavodu RS za transfuzijsko medicino, kjer dela pod mentorstvom prof. dr. Vladke Čurin Šerbec. Danes pa bodo na FKKT podelili tudi fakultetne Prešernove nagrade. S področja biokemije je nagrajenka Nives Škrlj, ki se je prejšnji mesec zaposlila kot mlada raziskovalka na naši katedri, njeno raziskovalno delo pa bo potekalo v sodelovanju s skupino prof. Čurinove, vendar na področju molekularne biotehnologije - humanizacije protiteles. Drugi nagrajenec, ki dobi nagrado s področja biokemije, je Igor Drobnak, zdaj mladi raziskovalec na Katedri za fizikalno kemijo FKKT. (8.12.)
• Na spletu se je pojavil nov blog v slovenščini, na katerem so objavljene informacije o novostih in zanimivostih s področja molekularne biologije in sorodnih ved, sintezne biologije, biologije sistemov, funkcijske genomike in drugih. Stran z naslovom Nove biologije ureja doc. dr. Marko Dolinar z naše katedre. Tudi obiskovalci so vabljeni, da prispevajo novice in komentarje. Z blogom je povezan tudi wiki, ki je trenutno (še) v delovni verziji in se bo verjetno kmalu selil na drug naslov. (15.1.07)
• Informativni dan za vse srednješolce, ki se zanimajo za študij na Fakulteti za kemijo in kemijsko tehnologijo UL, torej tudi za študij Biokemije, bo v petek (9. februarja) ob 11. in 15. uri in v soboto (10. februarja) ob 10. uri in to v predavalnici za glavno stavbo na Aškerčevi 5. Vse študije na fakulteti (razen Varstva pri delu in požarnega varstva) bomo predstavili hkrati; v petek je zato običajno v predavalnici velika gneča. Biokemija bo verjetno na vrsti zadnja, za predstavitev pa bo časa samo dobih 10 minut. Če imate vprašanja glede študija, se lahko z njimi obrnete na učitelja, ki bo predstavil posamezen študijski program - tudi po predstavitvi, lahko pa pošljete tudi e-sporočilo komur koli od zaposlenih pedagoških delavcev na naši katedri. (29.1.) 
• Sodelavka Katedre za biokemijo FKKT UL Nika Lovšin je v času podoktorskega usposabljanja na Kalifornijski univerzi v San Franciscu sodelovala pri raziskavah mišjih protivirusnih proteinov. Izsledke raziskave so objavili v prestižni znanstveni reviji Nature in je od 28. januarja naprej (do izida v tiskani reviji) dostopna tudi na spletu. Več o tem na spletni strani FKKT. (12.2.)  
• Univerzitetna prijavno-informacijska služba je danes objavila podatke o prijavah za vpis v 1. letnik visokošolskih zavodov. Za študij biokemije se je letos odločilo 85 kandidatov, kar je največ v zadnjih sedmih letih in drugo največje število od ustanovitve študija. Več kandidatov je bilo edino leta 1999, in to 94. (30.3.)
• V letošnjo slovensko ekipo, ki se je prijavila na mednarodno tekmovanje iz sintezne biologije iGEM2007, se je med sedmimi študenti uvrstilo pet študentov biokemije. Iz drugega letnika sta to Saša Jereb in Katja Kolar, iz tretjega letnika Andrej Ondračka in Peter Cimermančič, iz četrtega pa Anja Korenčič. Kriteriji za izbor so bili številni, predvsem pa je bilo pomembno, da so pripravili zanimiv predlog raziskovalne naloge. Preostala dva študentska člana ekipe sta Rok Gaber (4. letnik študija mikrobiologije) in Marko Bitenc (3. letnik biotehnologije). Raziskovalno delo bo potekalo na Katedri za biokemijo FKKT in v Laboratoriju za biotehnologijo Kemijskega inštituta.  (11.5.)
• Katedra za biokemijo FKKT bo dobila novega sodelavca. Pridružil se nam bo Miha Pavšič, ki končuje z doktorskim delom, v naslednjem študijskem letu pa bo prevzel vodenje nekaterih vaj za dodiplomske študente. Kot zanimivost: Miha je bil prvi študent, ki je (leta 2002) diplomiral iz Biokemije na Univerzi v Ljubljani. (6.7.)
• 24. septembra je doktorirala prva slovenska univerziteta diplomirana biokemičarka, Alja Videtič. Študij biokemije je končala avgusta 2004 z zagovorom diplomske naloge Preiskava mikrosatelitskih območij DNA pri raku želodca, ki jo je opravila pod mentorstvom prof. Radovana Komela. Za diplomo je istega leta dobila tudi Krkino nagrado. Vpisala se je na univerzitetni podiplomski študij Biomedicina, kjer je opravila vse študijske obveznosti, raziskovalno delo pa je opravljala v skupini prof. Komela, kjer je preučevala molekularno genetiko samomorilnosti in lani objavila dva članka s tega področja.
• 3. in 4. novembra se je študentska raziskovalna ekipa s področja sintezne biologije skupaj z mentorji udeležila srečanja ekip na univerzi MIT v Cambridgu (ZDA). S svojo raziskovalno nalogo "Virotrap: A synthetic biology approach against HIV" se je uvrstila v finale, torej med 6 najboljših ekip na svetu (sodelovalo je 57 ekip), v kategoriji Medicina in zdravje pa je zasedla prvo mesto. Od sedmih študentov v ekipi je bilo pet študentov biokemije (Peter Cimermančič in Andrej Ondračka iz 4. letnika, Katja Kolar in Saša Jereb iz 3. letnika in absolventka Anja Korenčič). Sodelovale so mentorice s Kemijskega inštituta, vodji ekipe pa sta bila prof. Jerala in doc. Dolinar.
• 7. decembra je dekan podelil nagrade najboljšim študentom naše fakultete. V okviru študija Biokemije so bili prejemniki: Vita Majce (fakultetna Prešernova nagrada za diplomsko delo), Vid Kočar (pohvala za najboljši uspeh v 1. letniku), Jan Lonzarič (pohvala za najboljši uspeh v 2. letniku) in Peter Cimermančič (pohvala za najboljši uspeh v 3. letniku). Študentski svet pa je podelil nagrade najboljšim učiteljem. Pri izvedbi programa Biokemija je nagrado dobil doc. Marko Dolinar. Vsi nagrajeni študentje so predstavljeni na posebni fakultetni strani. (10.12.)
• 15. in 16. februarja bo naša fakulteta organizirala informativni dan za srednješolce. Vse študijske smeri na Oddelku za kemijo in biokemijo in Oddelku za kemijsko tehnologijo bodo predstavili 15. 2. ob 11. uri v dvorani Kina Vič, 15. 2. ob 15. uri in 16.2. ob 10. uri pa v veliki predavalnici fakultete na dvorišču Aškerčeve 5. Študiji bodo predstavljeni splošno, profesorji in študenti pa bodo nato odgovarjali na konkretna vprašanja. Mogoč bo tudi ogled laboratorijev. Analiza vpisa v program Biokemija v preteklih letih je na ločeni strani. (12.2.)
• Nocoj ob 18. uri bo na naši fakulteti podelitev priznanja SOVA, to je priznanje Slovenskega društva za visokošolsko didaktiko. Prejemniki nagrade bodo mentorji študentske ekipe, ki je na mednarodnem tekmovanju iz sintezne biologije novembra lani osvojila prvo mesto v kategoriji Medicina in zdravje in s tem premagala ekipe nekaterih najodličnejših svetovnih univerz. Med mentorji sta prof. Roman Jerala (Kemijski inštitut), ki na naši fakulteti predava Bioinformatiko, in doc. Marko Dolinar s Katedre za biokemijo. (6.3.)
• 28. marca so bili objavljeni podatki o oddanih prijavah za vpis v prve letnike študijskih programov v letu 2008/9. Za študij biokemije se je odločilo 49 srednješolcev, kar je približno četrtina več kot je bilo razpisanih mest, vendar vpisa ne bomo omejili. To pomeni, da se bodo lahko vpisali vsi tisti srednješolci, ki bodo končali 4. letnik (ne glede na uspeh pri maturi) in so Biokemijo v prijavi navedli kot prvo izbiro, medtem ko se kandidati, ki so navedli Biokemijo kot drugo izbiro, letos ne bodo mogli vpisati na naš študij. Podatki za vse slovenske visokošolske organizacije so dostopni v formatu PDF. (10.4.)
• Vpis študentov v 1. letnik programa Biokemija bo 27. julija ob 12. uri v glavni stavbi fakultete na Aškerčevi 5 (več o vpisu). Z izvajanjem bolonjskega študijskega programa bomo začeli v študijskem letu 2009/10, tako da bo letošnja generacija zadnja, ki se bo vpisala na štiriletni dodiplomski študij Biokemije. (10.7.)
• Na fakulteti je večina priprav za prenovo študijskih programov po bolonjskih načelih opravljenih. Provstopenjski študijski program Biokemije je Senat Univerze v Ljubljani že sprejel, zdaj pa čaka na obravnavo na Svetu za visoko šolstvo RS. Pripravili smo tudi že predlog programa za magistrski študij, ki pa ga bodo pristojni organi obravnavali nekoliko kasneje. Z bolonjskim študijem bomo torej začeli v študijskem letu 2009/10. (28.7.) 
• Provstopenjski študijski program Biokemije še čaka na obravnavo na Svetu za visoko šolstvo RS, vseeno pa smo že pripravili brošuro, ki predstavlja osnovne značilnosti študija na prvi bolonjski stopnji. (15.10.) 
• Študentska raziskovalna ekipa naše univeze, v kateri so bi med sedmimi študenti tudi trije študenti biokemije (Vid Kočar, Jan Lonzarić in Katja Kolar), je na tekmovanju iz sintezne biologije iGEM 2008 na univerzi MIT dosegla izreden uspeh, saj je v konkurenci več kot 80 ekip z vsega sveta zasedla prvo mesto v skupni uvrstitvi in prvo mesto v kategoriji Medicina/zdravje. Vodja ekipe je bil prof. Roman Jerala, ki našim študentom predava Bioinformatiko, med mentorji pa je tudi diplomantka biokemije Karolina Ivičak. Delo so opravili na Kemijskem inštitutu. (17.11.)
• Ta teden je naša fakulteta podelila Samčeva priznanja. Med dobitniki Nagrade Maksa Samca za doktorsko delo je za področje biokemije nagrado dobil dr. Tomaž Vaupotič. Doktorsko delo z naslovom "Identifikacija in metabolni učinek diferenčno izraženih genov, odvisnih od signalne poti odziva HOG, pri halotolerantni črni kvasovki Hortaea werneckii, adaptirani na povišano slanost" je pripravil od mentorstvom prof. dr. Ane Plemenitaš na Medicinski fakulteti naše univerze. Več o nagrajencu in njegovem delu piše v reportaži s podelitve na spletni strani FKKT. (5.12.)
• Informativni dan za dijake, ki jih zanima študij biokemije, pa tudi drugih študijskih smeri na naši fakulteti, bo v petek, 13. februarja in v soboto, 14. februarja po razporedu, ki je objavljen na spletni strani FKKT. V študijskem letu 2009/10 bodo vsi programi potekali v 1. letniku po bolonjskem programu, višji letniki pa bodo programe dokončali po starih programih. Vpisa na 2. bolonjsko stopnjo še ne bo, pričakujemo pa, da bo razpisan doktorski študij po bolonjskem programu, na katerega se bodo lahko vpisali diplomanti starih programov brez diferencialnih izpitov. Podrobnosti o tem bodo znane kasneje. (4.2.)
• Potrjeni so tudi drugostopenjski bolonjski študijski programi na naši fakulteti. Zasnovo študija in seznam predmetov najdete na posebni spletni strani FKKT. Pripravljene imamo tudi že predmetnike za doktorski študij kemije, v okviru katerega bo mogoče izbrati tudi usmeritev Biokemija. Vpis na prenovljeni doktorski program naj bi bil mogoč že to jesen! (19.3.) 
• Objavljeni so podatki o prijavah za vpis za naslednje študijsko leto. Za študij biokemije se je odločilo 71 kandidatov, kar pomeni skoraj 80 % več kot je razpisanih vpisnih mest. Število mest bo vsekakor omejeno, tako da bodo imeli prednost kandidati z boljšimi ocenami in uspehom iz srednje šole. (2.4.)
• Senat Sveta za visoko šolstvo je 22. aprila odobril doktorski študijski program Kemijske znanosti, znotraj katerega bo mogoče izbrati tudi usmeritev Biokemija. Predmetnik bo kmalu predstavljen tudi na spletnih straneh FKKT, vpis pa bo mogoče že to jesen. Sicer pa fakulteta s 1. oktobrom dobi  novega dekana - izvoljen je bil 22. maja. To bo prof. dr. Anton Meden (na sliki s sedanjim dekanom, prof. dr. Stanetom Pejovnikom), ki bo fakulteto vodil 4 leta. Prof. Meden je doktoriral leta 1994, se potem eno leto izpopolnjeval na ETH v Zürichu, od leta 2006 pa je redni profesor za anorgansko kemijo na naši fakulteti. V 1. letniku bolonjskega programa Biokemija bo predaval Splošno kemijo.
  (25.5.)
• Vpis v prvi letnik bolonjskega študija Biokemije bo potekal v ponedeljek, 27. julija in bo prvič potekal elektronsko, vseeno pa bo potrebno vpis izvesti osebno na sedežu fakultete.
  Do 1. septembra pa se je treba prijaviti tudi za vpis na doktorski študij Kemijskih znanosti na naši fakulteti. Tudi ta študij bo potekal po novih (bolonjskih) programih. Tako kot doslej bo možno vpisati tudi usmeritev Biokemija. (22.7.)
• 
  

obnovljeno 4. avgusta 2009 // urednik